Все подвои плодовых культур по способу размножения разделяются на семенные (сеянцы) и клоновые (вегетативно размножаемые). В России преобладающая часть садов выращивается пока на семенных подвоях. Они отличаются легкостью размножения, устойчивостью к неблагоприятным почвенным и внешним условиям, хорошим развитием корневой системы. Однако привитые на сеянцах деревья, как правило, сильнорослые, поздно и медленно наращивают урожаи, уход за такими садами и уборка урожая в них затруднены.
Клоновые подвои при интенсивном плодоводстве имеют большее значение, чем семенные. Они позволяют регулировать силу роста, скороплодность, урожайность и долговечность привитых растений. Для клоновых подвоев характерна наследственная однородность, что обеспечивает высокую выравненность по развитию надземной части привитых деревьев. Это повышает производительность труда и создает лучшие условия для механизации рабочих процессов. Только клоновые подвои имеют группу слаборослых карликовых и полукарликовых подвоев, которые обеспечивают слабый рост, высокую скороплодность и урожайность деревьев. Небольшие размеры деревьев и высокая скороплодность позволяют резко увеличить плотность посадки и создать высокоинтенсивные сады с ранними и обильными урожаями.
Недостатками клоновых подвоев яблони и груши являются: пониженная морозоустойчивость корней, особенно у слаборослых подвоев; поверхностное распространение и слабое закрепление корней в почве; хрупкость корней некоторых форм; слабая укореняемость и плохая совместимость некоторых подвоев с отдельными сортами; передача вирусных заболеваний. Указанные недостатки учитываются при возделывании и устраняются с помощью специфических приемов агротехники (установка шпалер, использование вставки и т.д.), а также путем оздоровления. Сады на слаборослых подвоях, несмотря на их большие преимущества, требуют больших капитальных затрат на создание и обладают повышенной требовательностью к уровню агротехники.
В настоящее время имеется большое разнообразие клоновых подвоев у большинства плодовых пород. Больше всего их у яблони, подвои которой получают от двух разновидностей яблони низкой — парадизки (райки) и дусена, которые являются соответственно карликовыми и полукарликовыми. У груши слаборослые клоновые подвои созданы на основе айвы обыкновенной.
Вегетативные подвои, выведенные селекционным путем, называются типами, которые по классификации, предложенной на Ист-Моллингской опытной станции (Англия), обозначаются римскими цифрами: I, II, III, IV и т.д. Вначале перед ними ставили две заглавные буквы ЕМ, которые позднее заменили на одну букву М (Моллинг). Число таких подвоев достигло 27. Позднее при совместной работе этой опытной станции с институтом в Мертоне по выведению подвоев, устойчивых к красной кровяной тле, была получена серия подвоев, которые стали обозначать буквами ММ (Моллинг — Мертон) перед цифрами, начиная с номера 101. В дальнейшем римские цифры у всех подвоев были для удобства заменены на арабские (М9, М4, ММ106, ММ102 и т.д.).
В нашей стране карликовые подвои иногда называются парадизками, а полукарликовые — дусенами, хотя при создании большинства из них использовались и многие другие виды яблони. Новые подвои, полученные нашими учеными, имеют чаще цифровое обозначение (1-48-46, 54-118, 62-396 и т.д.), а иногда полное (парадизка Будаговского) или сокращенное (ПБ, В9) название. Подвои, полученные в других странах или учреждениях, часто имеют сокращенные буквенные обозначения.
У груши в качестве клоновых подвоев используются различные формы айвы, обозначаемые буквами А, В, С и др. (айва А, айва С).
Подвои косточковых пород также чаще имеют сокращенное буквенное обозначение, например АП-1, ВВА-1, СВГ-11-19 и др.
Среди клоновых подвоев наибольшую известность имеют: подвои английского происхождения М9, М27, М7, М26, ММ102, ММ104, М106, М2, МЗ, М4 и др.; подвои П. И. Будаговского и МГАУ (Мичуринск): парадизка Будаговского (В9), 62-396, 57-491, 57-146, 57-195, 57-366, 57-476, 57-545, 54-118, 57-233, 57-490, 62-223, 67(5)-32, 70-20-20, 71-3-150 и др.; подвои и интеркаляры С. Н. Степанова (Мичуринск): 3-5-44, 3-4-98, 3-4-73 и др.; подвои С. В.Трусевича (Краснодар): 1-48-46 (СК-1), 1-48-41 (СК-2); подвои Д. Н. Крылова, Р. Ц. Цаболова (Дагестан): Б7-35, Б16-20, Б9-19, Б17-32; подвои И.П.Бережного: ДОН 69-135, ДОН 70-049, ДОН 70-456; подвои А. П. Апояна (Армения): Арм 9, Арм 10, Арм 12, Арм 18; польские подвои Р11, Р22 и др.; шведский подвой А2; американские подвои серии MAC, Ottava и т.д.
Подвои южной и западноевропейской группы (типа М, ММ и др.) имеют невысокую зимостойкость и морозоустойчивость корней (не ниже —10... —12°С), тогда как подвои отечественной селекции, особенно из г. Мичуринска, — до —15... —16°С и ниже, т.е. на уровне семенных подвоев.
Многие клоновые подвои яблони селекции В. И. Будаговского имеют антоциановый пигмент в листьях, стебле и корнях.
Подбирая соответствующие подвои, создают сады различной степени интенсивности возделывания. В настоящее время доля садов на клоновых подвоях в садоводстве постоянно увеличивается. Наибольшую площадь они занимают в южных районах страны.